只取了5个卵泡做三代试管的成功率不高，因为三代试管会经过胚胎植入前的诊断与筛查，期间也就剔除一些不合格的囊胚，因此只取5个卵泡做三代试管的成功率不高。一般来说，无论是做一代、二代还是三代，基础卵泡取卵的数量在8-15个是比较合适的，但由于女性的年龄、卵巢功能、治疗方案、药物反应等情况的不同，所取出的卵子数量不一定有那么多。

当基础卵泡只有5个的情况下，如果一定要做三代试管，那就需要把供卵这个选项考虑上，不然的话就需要接受试管失败的后果。当然，在我国供卵试管虽是合法的，但是也需要满足一定的条件才能够做，因此大家在选择供卵的时候，还需要注意自己是否符合国家规定。或者是选择做二代试管，因为二代试管可以不经过养囊，那这样可移植胚胎就更多一点，成功率应该先对要高一些。

据了解，只取了5个卵泡做三代试管的成功率不高，因为5个基础卵泡最后只有2-3个囊胚。到了囊胚之后经过PGS筛查，还需要剔除一部分存在染色体异常、携带遗传致病基因或者特定性别的胚胎，那最后可能只有1-2个囊胚，或者一个也没有。因此成功率其实是相当低的。