移植胚胎的时候是按照患者自身意愿使用一个、两个、三个进行移植的，而且这两枚胚胎是独立存在的，所以试管中的两枚胚胎是可以分开进行移植的。但是在临床上是不建议将试管中的两枚胚胎分开进行移植的，毕竟移植导管在吸入其中一个胚胎的时候，可能会导致另一个胚胎的质量受损，尤其是冻胚，从而在移植另一个胚胎的时候，就会导致着床成功率有所下降。

试管婴儿就是将精子和卵子放入试管当中，然后在类似于子宫环境的实验室进行胚胎培养，使其形成鲜胚或者是冻胚，若是有做冷冻处理，就被称之为冻胚。一般来说，在做移植手术的时候，试管当中的两枚胚胎是可以分开移植的，但是不建议这么移植：

1. 1. 一支试管当中会有质量相差的不大的多个胚胎，如两个、三个等，对于拥有多个胚胎的试管来说，在做移植手术的时候，是可以将其分开进行移植的，毕竟移植胚胎的个数与患者自身意愿有关，即患者想要移植两个就移植两个，想要移植一个就移植一个，但是一次移植不能超过三个，而且每一个胚胎都是一个独立的个体，也就可以利用移植导管吸取其中一个胚胎进行移植；
2. 2. 当然在通常情况下，是不建议将试管中的两个或者是多个胚胎单独进行移植的，因为移植导管在吸取试管中胚胎的时候，可能会导致另一个胚胎质量受损，使其质量下降，尤其是冻胚，冷冻、解冻复苏之后再冷冻解冻复苏，更容易导致胚胎质量下降，进而导致移植成功率有所下降。

试管中的两枚胚胎虽然是可以分开进行移植的，但一般是不建议这么移植的，当然具体要不要分开移植看自身医院，患者可以咨询医生之后再权衡。