二代试管宝宝畸形率与正常怀孕差不多，毕竟宝宝畸形主要是由于孕期滥用药物、孕期母亲感染某些微生物、父母亲的遗传物质异常、环境污染噪音污染等等导致，而与怀孕方式即二代试管怀孕与自然怀孕是没有任何关系的。所以无论是哪种方法怀孕，在孕期都需要按时去医院参加各项产检，尤其是那些排畸检查，如nt检查、四维排畸检查等等。

二代试管就是单精子卵胞浆内显微注射(ICSI)，它指的是医生将精子和卵母细胞固定好后，再将精子吸入纤维注射针内，直接注射入卵母细胞胞浆内，使其受精成为受精卵后在经实验室人员培养成胚胎之后移植到女性子宫，已达到怀孕的目的。一般来说，该方法受孕与自然怀孕宝宝出现畸形的概率都是产不多的，即：

1. 1. 孕期滥用药物：药物对胎儿的致畸作用最敏感时期是怀孕3个月之内，该该阶段，如果在器官细胞合成分化过程中受到药物干扰，就会造成胎儿器官畸形；
2. 2. 母亲感染某些微生物：孕期母亲感染某些微生物可导致胎儿感染并导致胎儿畸形，如风疹、巨细胞、单纯疱疹、弓形虫、梅毒等，可增加胎儿畸形的风险，主要是先天性心脏病、神经管畸形、唇腭裂等；
3. 3. 父母亲的遗传物质异常：如父母染色体异常、父母携带突变基因等，有时是受精卵自身发生了染色体分离异常或基因突变，近亲结婚时由于夫妻双方携带相同异常基因的风险增加，导致某些隐性遗传病的发病率显著增加；
4. 4. 环境污染噪音污染：妊娠期间孕妇过多地接触有毒有害物质，化学剂某些药物可导致胎儿畸形，尤其是在早孕期使用时，另外重金属（汞、铅等）增加胎儿畸形的风险，当然城市汽车尾气、噪音等也是引起胎儿畸形的罪魁祸首之一。

由此可见，导致胎儿畸形的原因与怀孕方式并没有关系。所以建议利用二代试管技术助孕的家庭也不要太过担心了。同时在怀孕期间，一定要注意避免影响所提及的几种导致胎儿畸形的情况，也就能够有效地避免胎儿畸形。

总的来说，胎儿畸形与怀孕方式没有关系，但是想要预防胎儿畸形，就需要注意导致胎儿畸形的几种情况。同时还需要注意在怀孕积极参加各种排畸检查。