目前南京对于试管婴儿方面掌握熟练，并且已经在长期开展治疗的医院一共有6家权威医院，分别是江苏省人民医院（江苏省妇幼保健院）、南京鼓楼医院、南京医科大学第二附属医院、南京市妇幼保健院、东南大学附属中大医院、江苏省中医院。这六所医院目前开展的相同治疗项目有夫精人工授精技术、常规体外受精-胚胎移植技术、卵胞浆内单精子显微注射技术，其中江苏省人民医院（江苏省妇幼保健院）、南京鼓楼医院、南京市妇幼保健院三家还提供供精试管婴儿技术以及第三代试管婴儿技术。所以仅仅从技术全面性来看这三家医院排名比较靠前。

1、江苏省人民医院（江苏省妇幼保健院）

配备了经验丰富的医护团队及技术精湛的胚胎专家，实施包括夫精人工授精（IUI-AIH）、供精人工授精（IUI-AID）、和各项试管婴儿的技术，包括单精子卵浆内注射（ICSI）、卵子精子和胚胎冷冻、睾丸和附睾穿刺、卵子捐赠、胚胎囊胚培养、卵母细胞体外成熟（IVM）、胚胎植入前遗传学诊断和筛查（PGD/PGS）等，各个试管婴儿技术项目均可在这里完成。

2、南京鼓楼医院

常规开展宫腔内人工授精技术 (IUI)、体外受精-胚胎移植 (IVF-ET)、卵细胞浆内单精子注射技术 (ICSI)、配子与胚胎冻融技术、胚胎种植前遗传学诊断/筛查技术 (PGD/PGS)、卵子赠送技术、未成熟卵体外成熟培养技术 (IVM) 等一系列辅助生殖技术。

3、南京市妇幼保健院

南京市妇幼保健院生殖医学中心成立于2000年，现拥有临床及实验室工作人员12 名，采用先进的检测手段开展常规体外受精—胚胎移植（IVF-ET）、单精子卵胞浆内注射（ICSI）、胚胎冷冻、精子冷冻、睾丸（附睾）穿刺活检、习惯性流产的免疫治疗、宫内人工授精（夫精（IUI）、卵巢囊肿穿刺、内膜活检、B超下输卵管通液、各种方案的促排卵治疗及B超监测排卵等项目。