上海市中西医结合医院是一所有明显特色的三级甲等中西医结合医院，已拥有1个全国医疗中心、3个上海市医疗中心、2个上海市领先医疗特色专科、4个虹口医疗品牌建设专科，另有特色专科10多个。核定床位446张，职工800余人，目前该院暂未开展人工授精、夫精人工授精技术、供精人工授精技术、常规体外受精-胚胎移植技术、卵胞浆内单精子显微注射技、植入前胚胎遗传学诊断技术等辅助生殖技术，也不能提丶精子库捐精、供精人工授精、卵子库供卵等助孕服务。

医院职能科室设置：院长办公室、党委办公室（文明办）、宣传科（外联办公室）、医务科（下辖医疗质量监督管理科）、科教科、医疗纠纷办公室、护理部、感染管理科、人事科、财务科、内审办公室、经营核算办公室、医疗保险办公室、防保科、保卫科、总务基建科、设备科、离退办、信息科（病案室）。