盐城市中医医院是南京中医药大学直属盐城附属医院、国家传承创新项目重点建设中医院、重点建设地市级中医医院；长春中医药大学、安徽中医药大学、扬州大学医学院等9所高等医学院校的教学医院；国家首批中医类别住院医师规范化培训基地、中医类别全科医生规范化培养基地。目前该院暂未开展人工授精、夫精人工授精技术、供精人工授精技术、常规体外受精-胚胎移植技术、卵胞浆内单精子显微注射技、植入前胚胎遗传学诊断技术等辅助生殖技术，也不能提丶精子库捐精、供精人工授精、卵子库供卵等助孕服务。

医院开设临床及医技科室41个、设置运行病区32个，有国家级重点专科2个（儿科、肿瘤科）、省级重点学科1个（中医儿科学）、省级重点专科6个（骨伤科、脾胃病科、心血管科、针灸脑病科等）、市级重点专科19个（肺病科、肝病科、肾病科、内分泌科、肛肠科、中医外科、急诊科、妇科、皮肤科、康复科、中药学、中医护理、治未病科等）；医院现有全国名老中医药专家传承工作室4个，开设专病门诊47个，开展中医诊疗项目78项、中医特色护理项目26项，专科专病医院特色制剂57种。