乐清市妇幼保健院承担着全市妇幼保健业务指导、医疗保健产科质量监督评价和《出生医学证明》管理工作，是集保健、预防、医疗、科研、教学于一体的妇女儿童专科医疗保健机构，承担着全市妇女的医疗保健任务，是温州市首家国家级“爱婴医院”。目前该院暂未开展人工授精、夫精人工授精技术、供精人工授精技术、常规体外受精-胚胎移植技术、卵胞浆内单精子显微注射技、植入前胚胎遗传学诊断技术等辅助生殖技术，也不能提丶精子库捐精、供精人工授精、卵子库供卵等助孕服务。

乐清市妇幼保健院履行和承担着全市妇女儿童保健的业务指导、调研、培训任务，协助卫生行政部门做好公共卫生工作中的妇幼保健的管理督导工作，是县级妇幼保健网络的龙头单位。医院秉承“仁爱、精医、友好、创新”的妇幼精神，坚持保健与临床相结合，不断拓宽保健服务领域，为妇女、儿童生命周期各个阶段提供保健医疗—体化服务，开设系列保健专科特色门诊，建立妇幼各期保健综合服务体系。