安徽医科大学第二附属医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复等多功能于一体的三级甲等现代化综合性医院，院内以科学的流线设计将医用、人流、物流科学分开，配以全面集成数字化信息系统、完善的生活休闲服务设施，构筑了一座花园式、人性化的舒适性医院，2018年被评为首届中国最美医院。目前医院暂未开展人工授精、夫精人工授精技术、供精人工授精技术、常规体外受精-胚胎移植技术、卵胞浆内单精子显微注射技、植入前胚胎遗传学诊断技术等辅助生殖技术，也不能提丶精子库捐精、供精人工授精、卵子库供卵等助孕服务。

医院学科齐全，综合诊疗水平高，共开设40余个临床医技科室，拥有肿瘤科、麻醉与围术期医学科、呼吸与危重症医学科、骨科、泌尿外科、肾脏内科、血液内科、儿科、检验科、耳鼻喉头颈外科、眼科11个省级临床重点专科。以重点学科为依托，整合资源，协调发展，形成具有医院特色的学科建设方向。