古田县妇幼保健院是一所以妇女儿童为主要服务对象的医疗保健非盈利妇幼保健院。为全县妇女儿童提供围产保健、妇女保健、儿童保健等妇幼保健服务和妇女儿童常见病防治、助产技术服务等，履行计划生育公共服务职能，承担全县妇幼保健业务管理、培训和技术指导工作的相关事务性、辅助性、技术性工作。目前该院暂未开展人工授精、夫精人工授精技术、供精人工授精技术、常规体外受精-胚胎移植技术、卵胞浆内单精子显微注射技、植入前胚胎遗传学诊断技术等辅助生殖技术，也不能提丶精子库捐精、供精人工授精、卵子库供卵等助孕服务。

医院业务科室设置有保健和临床两部分：保健部除承担全县妇幼健康服务项目实施和信息管理等工作外，还设妇女保健、儿童保健、婚前保健等科室。临床科室开设有：产科、妇科、儿科、新生儿科、儿童康复科、中医科、麻醉科、医技科、药剂科等科室。