准格尔旗中蒙医院是一所集医疗、预防、保健、康复、教学、科研为一体的具有中蒙医特色的国家“三级乙等中医蒙医医院”。整体占地面积12000平方米,建筑面积30000平方米。准格尔旗中蒙医院总体由门诊楼、医技楼、东西住院楼、体检楼、感染性疾病楼等五部分组成。目前该院暂未开展人工授精、夫精人工授精技术、供精人工授精技术、常规体外受精-胚胎移植技术、卵胞浆内单精子显微注射技、植入前胚胎遗传学诊断技术等辅助生殖技术,也不能提丶精子库捐精、供精人工授精、卵子库供卵等助孕服务。
医院内设党组织办公室、医院办公室、人力资源管理科、医务科、护理部、科教科、计划财务科、总务科、药剂科、临床药学部、质量管理科、感染管理科、信息科、物价审计科、医学装备管理科、公共卫生科、医共体办公室、健康教育科、宣传科、安全管理办公室、绩效管理办公室、医改办、医保科等党政职能科室和急诊科、内科(肺病科<呼吸与危重症医学科>、心血管病科、脾胃病科、老年病科、内分泌科、脑病科、肾病科)、外科、骨伤科、妇产科、儿科、针灸科、推拿科、肛肠科、皮肤性病科、蒙医科、康复科、口腔科、眼科、耳鼻咽喉科、重症医学科、感染性疾病科、麻醉科、治未病中心等临床科室,设检验科、医学影像科、超声医学科、功能检查科、内窥镜室等医技科室。